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波兰苏占区的情况同样糟糕。一百多万波兰人被斯大林的NKVD警察组织流放到西伯利亚。几千名被红军俘虏的波兰军官遭到处决后埋入卡廷的森林中。德国人后来发现了这些万人坑，西方盟国竭尽全力，禁止披露苏联这一暴行的证据，生怕影响与斯大林的联盟。
1941年6月22日，希特勒发动对苏联的入侵。这是他希望看到德国领土向东扩展的最终体现。为达到这个目的，被占领土上的斯拉夫人必须为新来的德国定居者让路。许多苏联人沦为奴隶，而其他人只能等着被饿死。从一开始，交战双方都没有表现出对尊重既定战争规则的丝毫内疚。在北面指挥德国第46装甲军的埃里希·冯·曼施泰因(译注：曼施泰因当时指挥的是第56摩托化军)，亲眼目睹了一支遭到切断并被消灭的德军侦察部队遗留下的尸体。许多尸体遭到蓄意破坏。[20] 但在其他地方，德国军队也毫不犹豫地对苏军战俘使用了最残酷的手段。
埃里希·科赫将夺取苏联领土视为扩大自己权力范围的一个机会，1941年7月，他被任命为驻乌克兰帝国专员。他成功地说服希特勒将比亚韦斯托克周边的领土划入他的管辖范围，这使他获得了一条从波罗的海到黑海、连贯的陆地通道。比亚韦斯托克原本属于波兰，1939年，德国军队把它交给了苏联红军。即便以东欧的标准来看，这也是片严重欠发达地区，其面积比东普鲁士略小，150万人口中的大多数居住在小小的农场和村庄里。对该地区非德国居民的限制极为严格——不必要的外出，使用电话和邮政服务，甚至就业类型，都遭到限制。限制流动给居住在这片广大农村地区的居民造成极大的困难，导致了普遍性食物短缺。对大多数犯罪行为的惩处是执行死刑，这里还采取了“共同责任“政策，个别人的品行不端会让整个村子遭受惩罚。整个省只是在尽可能少投入的情况下被充分加以利用的一件物品；科赫指出，“就算有一百万外国人……“不得不挨饿，那也无关紧要。[21]
科赫在领土分配上最大的收获是乌克兰。希特勒将乌克兰视为东部征服过程中最重要的地区，并坚持认为必须派他最得力的大区领袖对其加以管理。这片地区相当庞大，约为340 000平方公里，居民人数1 700万，其中有150万犹太人。科赫自觉地让自己与希特勒的观点靠拢，明确表述了他将如何统治乌克兰：
如果这些人每天工作十小时，那么，其中的八个小时必定是为我们干的。一切多愁善感的想法必须放到一旁。必须以铁一般的力量对这些人加以管束，这样，他们将帮助我们赢得这场战争。我们解放他们不是为了乌克兰的利益，而是为德国提供基本生存空间，并确保我们的粮食供应。[22]
在波兰和比亚韦斯托克，当地居民被禁止跟德国人居住在一起，他们的行动也受到严格限制。在乌克兰采取了相同的措施，曾张开双臂欢迎德国解放者的乌克兰人，迅速产生了对占领者的仇恨。由于整片地区在战前遭受过大规模饥荒，反苏情绪非常强烈，但德国没能对这个也许能让他们赢得东线战争的绝佳机会加以利用。数百万吨粮食和其他农产品被攫夺，并被运回德国，这在乌克兰居民中造成普遍性饥荒。更糟糕的是，大批乌克兰男人被征入军队，再加上严厉的占领政策，导致被耕作土地的数量大幅度下降——与战前相比，1942年播撒的谷物只有63%，收成也只有战前的39%。对科赫和他的助手们来说，唯一重要的是有足够的农产品被运往德国——乌克兰人的命运完全不需要加以重视。为提高自己的形象，科赫安排“乌克兰火车“搭载着乌克兰的农产品运往德国各大城市，这个举动得到德国媒体的广泛报道。食物包也被送至前线来自东普鲁士的士兵们手中，科赫利用他对东普鲁士媒体的控制，渲染出这样一幅画面：省内的乌克兰人，对德国人把他们从布尔什维克手中解放出来感激涕零，心甘情愿地为他们的新主人卖力劳动。但真实情况完全不是这样。
随着战争的继续，与其他地区一样，乌克兰的游击队越来越多。一些组织对这些游击队展开努力清剿——党卫队，国防军部队，甚至包括科赫和他的部下们组织起来的、不受军方指挥的单位。这些反游击部队，特别是党卫队和国防军以外的单位，平叛效果极其有限，然而这并不能阻止他们杀掉成千上万名平民以示报复。而游击队对德军后方单位、桥梁和铁路线的破坏行为几乎从未停止过。科赫的几名部下成了暗杀行动的受害者。尽管抵抗组织也策划了几次暗杀科赫本人的行动，但科赫很少待在乌克兰，这些行动没有获得成功。到1942年年底，在乌克兰部分地区，德国当局的触角几乎已延伸至较大城镇的边缘，这进一步减少了可获得的收成。为饿死游击队，德国人通常会将牲畜和其他一切食物来源运离农村。再加上严格限制当地居民的流动，这些措施导致饥荒和疾病引发的死亡率不断上升。相关机构(国防军指挥官、党卫队、科赫和他的下属)的重叠竞争也进一步削弱了德国人的努力。
尽管许多德国军官后来把反游击战中所犯暴行的罪责推给党卫队，但有充分证据表明，德国国防军同样有罪。1941年7月16日，一道命令下达给所有德军部队：
采取所有行动和所有措施的首要原则是，必须无条件地确保德国士兵的安全……只有在敌对平民表现出的每一个威胁遭到无情的处理后，才有可能顺利实现对乡村的清剿。所有心慈手软都是软弱的证明，并会构成一种危险。[23]
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